为深入贯彻党的二十届三中全会“完善促进海洋经济发展体制机制”的重大部署、省委十四届七次全会“大力发展海洋新质生产力”的工作要求，全面落实全省沿海地区高质量发展会议和全市海洋强市工作推进会精神，围绕构建“3+2+2+X”涉海产业体系，进一步推动南通市人民政府与南通大学“名城名校”融合发展战略落地见效。2024年12月27日南通大学与启东市人民政府签约共建南通大学启东海洋研究院。研究院位于启东市汇龙镇世纪大道2099号启睿产业中心6幢，共计1487平方米。
研究院依托南通大学在海洋领域人才、科研和学科优势，结合南通海洋产业需求，有效整合双方优质资源，着力打造集海洋技术研发与成果转化、涉海项目培育与孵化、创新创业人才引进与培养的海洋研究院，并谋划共建海洋学院，助力南通发展新质生产力。
研究院聚焦南通海洋产业“卡脖子”技术需求，围绕海洋生物、海洋药物、海洋特种医学、海洋绿色新能源等方面开展前瞻性和应用性研究；依托南通大学技术转移中心启东分中心，推动海洋科技成果孵化；集聚一批海洋产业创新人才。
